Trong đó, có 6 người bị cáo buộc phạm tội “Vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng”, gồm Nguyễn Thị Hòa, giám sát kế toán của 3 doanh nghiệp nói trên (đang bỏ trốn); Nguyễn Đăng Thuyết, Tổng giám đốc Công ty Thành An; Bùi Thị Mai Hương, kế toán trưởng Công ty Thiết bị y tế Danh...

Ngoài ra, có 32 người bị đề nghị truy tố về tội “In, phát hành, mua bán trái phép hóa đơn, chứng từ thu nộp ngân sách nhà nước”.

Theo kết luận, trong giai đoạn từ năm 2017 - 2022, tại Công ty Thành An, Công ty Danh, Công ty Tràng Thi, các bị can lập 2 hệ thống sổ sách kế toán trên phần mềm FAST gồm hệ thống sổ kế toán tài chính nội bộ để ghi nhận toàn bộ số liệu thực thu, thực chi, kết quả kinh doanh thực tế.

Hệ thống thứ 2 là sổ kế toán tài chính thuế để khai man số liệu, lập các báo cáo tài chính, báo cáo thuế với các cơ quan quản lý nhà nước, tăng chi phí đầu vào, tăng giá vốn hàng bán dẫn tới giảm lợi nhuận, giảm thuế phải nộp.

Việc quản lý hai hệ thống sổ kế toán nêu trên được Nguyễn Đăng Thuyết chỉ đạo các kế toán nhóm Công ty Thành An trực tiếp thực hiện. Trong đó, bị can Đỗ Thị Hoa, Kế toán trưởng doanh nghiệp này thực hiện việc kiểm soát toàn bộ hoạt động thu chi thực tế (được ghi nhận trên phần mềm sổ kế toán nội bộ) và số liệu kê khai thuế (số liệu không đúng) của cả 3 công ty.

Để hợp thức, các bị can tiến hành mua hóa đơn khống của các công ty/hộ kinh doanh cá thể từ 32 đầu mối rồi cùng hưởng lợi. Từ năm 2017 - 2022, đường dây này mua 19.167 hóa đơn khống (mặt hàng là danh mục vật tư y tế) của 110 công ty/hộ kinh doanh với tổng giá trị tiền hàng trước thuế là 3.689 tỉ đồng, thuế VAT là hơn 75 tỉ đồng. Trong đó, chi phí mua hóa đơn là 257 tỉ đồng.

Việc hạch toán đối với 19.167 hóa đơn khống (không có hàng hóa) mua của 110 công ty/hộ kinh doanh được các bị can cập nhật vào phần mềm kế toán thuế (hệ thống sổ kế toán thuế) nhằm tăng chi phí, giảm thuế phải nộp; còn phần chi phí mua hóa đơn khống và các phần thực thu, thực chi khác được Đỗ Thị Hoa theo dõi trên phần mềm số kế toán nội bộ.

Cảnh sát điều tra kết quả kinh doanh của 3 công ty trong giai đoạn 2017 - 2022, cho thấy tổng tài sản và tổng nguồn vốn là hơn 8.542 tỉ đồng; tổng lợi nhuận trước thuế 562 tỉ đồng; lợi nhuận sau thuế 448 tỉ đồng; tổng số tiền thuế thu nhập doanh nghiệp nộp ngân sách là hơn 114 tỉ đồng.

Tuy nhiên, tài liệu trích xuất từ hệ thống phần mềm FAST nội bộ tại Công ty Thành An, Danh, Tràng Thi lại khác. Cụ thể, 3 doanh nghiệp này có tổng tài sản và tổng nguồn vốn là hơn 12.828 tỉ đồng; tổng lợi nhuận trước thuế là 2.655 tỉ đồng; tổng lợi nhuận sau thuế là 2.563 tỉ đồng.

Như vậy, giữa sổ sách công khai và nội bộ có sự chênh lệch, cụ thể là tổng tài sản và nguồn vốn tăng 4.286 tỉ đồng; lợi nhuận trước thuế tăng 2.092 tỉ đồng.

Quá trình điều tra, Giám định viên Cục Thuế Hà Nội ban hành kết luận thể hiện về thuế giá trị gia tăng, các Công ty Thành An, Công ty Danh, Công ty Tràng Thi đã sử dụng 19.167 hóa đơn khống để kê khai khấu trừ thuế GTGT hàng hóa dịch vụ mua vào dẫn đến làm giảm tiền phải nộp, gây thiệt hại cho ngân sách hơn 62 tỉ đồng.

Về thuế thu nhập doanh nghiệp, việc 3 doanh nghiệp nói trên dùng hóa đơn khống, được mua từ các công ty và của các hộ kinh doanh để hạch toán kế toán khi làm báo cáo tài chính, xác định số thuế phải nộp đã làm giảm số tiền thuế là hơn 680 tỉ đồng. Do vậy, hành vi của các bị can gây thiệt hại tổng cộng hơn 743 tỉ đồng.

Nhật Anh