Theo Bộ NN-PTNN, công tác thanh tra, kiểm tra, xử lý vi phạm tại nhiều địa phương còn tồn tại, bất cập và chưa hiệu quả. Nhiều vụ việc xảy ra ở các địa phương trong thời gian dài nhưng không được cơ quan chức năng tiến hành thanh tra, xử lý vi phạm theo đúng quy định của pháp luật.