Trong quá trình thực hiện, Huỳnh Văn Dõng - Giám đốc, Tổ trưởng Tổ chuyên gia đấu thầu CDC Khánh Hòa không thực hiện mua sắm theo quy định của Luật Đấu thầu mà câu kết, thống nhất để Công ty VNDAT giao hàng hóa trước theo hình thức cho mượn, ứng trước để CDC Khánh Hòa sử dụng.