Trong số này, đáng chú ý là trường hợp Công ty Sumitomo Bakelite Việt Nam. Công ty 100% vốn Nhật Bản có trụ sở tại khu công nghiệp Thăng Long (Hà Nội) này có số lỗ lũy kế 3 năm lên tới hơn 777 tỉ đồng.
Cũng tại Hà Nội, Công ty điện tử Meiko Việt Nam có số lỗ 3 năm là hơn 300 tỉ đồng. Meiko Việt Nam chính thức được trao giấy chứng nhận đầu tư vào khu công nghiệp Thạch Thất – Quốc Oai ( Hà Nội) vào cuối năm 2010. Nhà máy của Meiko tại Hà Nội là một trong 10 dự án đầu tư trực tiếp nước ngoài (FDI) lớn nhất năm 2006 và là dự án sản xuất điện tử có vốn FDI lớn nhất vào Việt Nam tại thời điểm cấp phép.
Đồng Nai đóng góp tới 4 cái tên trong danh mục doanh nghiệp khai lỗ lớn được kiểm tra đợt này, trong đó đáng chú ý là Công ty sản phẩm công nghiệp Toshiba Asia với mức lỗ lũy kế 3 năm là hơn 430 tỉ đồng.
Xếp tiếp theo trong danh sách là Công ty Fujitsu Việt Nam với số lỗ lũy kế 2 năm là hơn 292 tỉ đồng. Sau 13 năm hoạt động tại Việt Nam, công ty này đã đầu tư trên 200 triệu USD và từng đạt mức doanh thu xuất khẩu lên tới gần 500 triệu USD vào những năm 2006-2007, nhưng hiện nay doanh thu sụt giảm mạnh.
Hai cái tên đáng chú ý còn lại cũng thuộc địa bàn Đồng Nai là Công ty Kureha Việt Nam với mức lỗ lũy kế 3 năm là 264 tỉ đồng và Công ty Olympus Việt Nam với mức lỗ lũy kế 2 năm là 256 tỉ đồng.
TP.HCM và Bình Dương cũng “đóng góp” hai đại diện trong danh sách lỗ lớn được thanh tra, bao gồm Công ty Freetrend Industriala Việt Nam (TP.HCM) với mức lỗ 2 năm là trên 222 tỉ đồng và Công ty Saigon Stec (Bình Dương) với mức lỗ lũy kế 3 năm trên 218 tỉ đồng.
Tuy nhiên, điều mà Thanh tra chính phủ phát hiện là trong bối cảnh khai lỗ liên tục và lớn, một số doanh nghiệp vẫn có “tốc độ tăng doanh thu hàng năm vẫn cao, hoạt động sản xuất kinh doanh liên tục được mở rộng, nhiều doanh nghiệp đã có số lỗ vượt quá số vốn chủ sở hữu”.
Cơ quan này cũng cho rằng việc sản xuất kinh doanh của doanh nghiệp chế xuất không hiệu quả do nhiều nguyên nhân, trong đó “có nguyên nhân từ việc chuyển giá trong giao dịch liên kết”. Tình trạng này đã “không chỉ gây thất thu ngân sách mà còn tạo nên sự mất công bằng trong việc thực hiện nghĩa vụ thuế, tạo nên sự cạnh tranh không lành mạnh, ảnh hưởng đến môi trường đầu tư và nhiều hệ quả xã hội khác”.
Tuy nhiên, cho đến nay, do không xác minh được thông tin đầu ra đối với các doanh nghiệp nước ngoài nên cơ quan thuế không đủ cơ sở để xem xét, xử lý tình trạng này.