Bão lũ thường khiến các bệnh truyền nhiễm lây lan nhanh. Khu vực bị ảnh hưởng bởi bão lũ dễ bùng phát hơn, đặc biệt sau khi nước lũ rút đi.
Nhìn chung bão lũ làm tăng nguy cơ lây lan bệnh nhiễm trùng đường hô hấp, bệnh do vật trung gian (ký sinh trùng, muỗi) cùng bệnh do nước ô nhiễm. Việc nâng cao nhận thức và tiến hành phòng ngừa là vô cùng quan trọng.
Bệnh nhiễm trùng đường hô hấp như ho, cảm lạnh, cúm, viêm phổi thường bùng phát do thời tiết ẩm ướt cùng môi trường đầy vi khuẩn sau bão. Hạ tầng y tế bị tàn phá cũng khiến người mắc bệnh không được điều trị kịp thời.
Việc dùng phải thức ăn hoặc nước nhiễm khuẩn gây bệnh tả, lị trực khuẩn, thương hàn. Triệu chứng phổ biến là sốt, nôn mửa, tiêu chảy. Ngoài ra cũng cần cẩn thận với sốt xuất huyết do muỗi truyền bệnh.
Biện pháp phòng ngừa có thể thực hiện bao gồm giữ gì vệ sinh khi ăn, xử lý nước uống bằng clo dạng viên nén khử trùng, uống nước ấm và dung dịch điện giải (ORS) thường xuyên, rửa sạch tay trước khi ăn, mắc mùng ngủ để tránh muỗi đốt, đậy kỹ thức ăn, dọn sạch nước đọng, tránh tiếp xúc với người đã mắc bệnh...